Nasceu em Utrecht, Holanda, no ano de 1953. Realizador, argumentista e ilustrador, vencedor dos mais importantes prémios audiovisuais pelos seus trabalhos de animação.

Estudou gravura em Genebra e animação em Farnham (Inglaterra), onde realizou o seu primeiro filme: A Entrevista (1978). Após um ano a trabalhar em animação em Barcelona, ​​estabeleceu-se em Londres em 1980. Trabalhou como freelancer em vários estúdios, em particular na produtora Richard Purdum Productions, onde realizou e animou inúmeros anúncios publicitários premiados para televisão e cinema.

Em 1992, criou a sua curta-metragem Tom Sweep (1992), seguindo-se O Monge e o Peixe (1994), produzida pelo estúdio francês Folimage. Com este filme, ganhou o César de melhor curta-metragem de animação, além de ter recebido importantes nomeações para os Óscares e para os BAFTA. A sua curta-metragem mais conhecida, Pai e Filha (2000), ganhou o Grande Prémio de Annecy, um Óscar e um BAFTA.

A sua estreia como realizador de longas-metragens contou com o apoio de Isao Takahata, um dos fundadores do lendário Studio Ghibli (A Viagem de Chihiro, O Meu Vizinho Totoro…), tornando-se a primeira produção estrangeira do estúdio. O resultado foi A Tartaruga Vermelha (2016), considerado uma obra-prima da animação. O filme foi nomeado para os Óscares e ganhou o Prémio Especial “Un Certain Regard” no Festival de Cannes de 2016, para além de inúmeros prémios internacionais.

As produções de Michaël Dudok de Wit destacam-se pela delicadeza e minúcia na execução, base fundamental de um estilo marcado pela nostalgia e pela melancolia.