Nasceu em Nagoya, Japão em 1964. É ilustrador, animador, produtor e realizador de cinema de animação.

Yamamura fez o seu primeiro filme de animação aos 13 anos. Entre 1983 e 1987, estudou pintura na Universidade de Artes de Tóquio, do qual recebeu diploma de bacharel em Design e Belas Artes. Enquanto estudante, trabalhou como assistente de arte e modelador de efeitos especiais para grandes produções cinematográficas. Foi influenciado por curtas-metragens de animação do Canadá, Rússia e Europa.

Após a sua formação inicial, iniciou carreira como animador no Estúdio Mukuo. Em 1989, deixou o estúdio para trabalhar como freelancer e, em 1993, fundou a Yamamura Animation Inc. com a sua esposa, Sanae. No ano de 2002, assinou um contrato com a Acme Filmworks, como diretor de animação.

Yamamura criou diversas curtas-metragens de animação utilizando uma variedade de técnicas:

Mt. Head (2002) foi nomeado para os Óscares em 2003 e recebeu 6 Grandes Prémios, incluindo Annecy 03, Zagreb 04 e Hiroshima 04. Foi também selecionado como um dos 100 FILMES PARA UM SÉCULO DE ANIMAÇÃO e um dos 50 Melhores Filmes de Animação para os 50 Anos do ASIFA.

Outros filmes amplamente distinguidos são: Frank Kafka’s a country doctor (2007), Dozens of norths (2021), My inner ear quartet (2023), Extremly short (2024), sendo o único realizador a vencer o Grande Prémio em cinco dos principais festivais internacionais de animação do mundo.

É também um autor ativo de livros ilustrados, com mais de 100 títulos publicados.

É professor convidado na Universidade de Artes de Tóquio, na Academia de Artes da China, na Universidade de Artes de Aichi e professor na Universidade de Artes de Tóquio desde 2008. É palestrante e realiza masterclasses em festivais de cinema em todo o mundo, incluindo a Universidade de Harvard e a Universidade de Tóquio.

Membro da Academia de Artes e Ciências Cinematográficas e membro da direção da Associação Japonesa de Animação (JAA). É diretor da Divisão de Artes dos Media do Festival de Hiroshima e Diretor Artístico da Temporada de Animação de Hiroshima desde 2021.

Foi galardoado com o Prémio Kawakita e o Prémio de Incentivo às Artes no Japão.