Nació en Chaves en 1920. Se licenció en arquitectura en la Escuela de Bellas Artes de Oporto y asistió a la Escuela de Bellas Artes de París en 1946, ciudad donde residió durante muchos años y donde tuvo la oportunidad de desarrollar sus conocimientos y contactos , habiendo trabajado en el estudio por Corbusier y vivió con Vasarely con quien le unía una relación de amistad y una afinidad a nivel estético. 

Optando definitivamente por la pintura, Nadir Afonso abandonó la arquitectura en 1965, manteniendo, sin embargo, muchos vínculos con su formación como arquitecto, en la forma en que privilegia las arquitecturas urbanas, dentro del lenguaje de un geometrismo que empezó a definir su estilo, a partir de años cincuenta en adelante, integrando el movimiento en la serie 'Espacillimité'. en 1955, y posteriormente al lenguaje que mejor define el estilo del artista, un geometrismo con referencias figurativas a paisajes urbanos reales o inventados.

Fue autor de importantes obras públicas como el proyecto de la Panificadora de Chaves (edificio de interés municipal y una de las 100 obras más significativas de la arquitectura portuguesa del siglo XX), los paneles para la estación de los Restauradores del Metropolitano de Lisboa (1996), creó, en 2006, un panel de azulejos para la Estación de Coina, creó un panel de azulejos para el Ayuntamiento de Boticas, en 2009 y creó paneles de azulejos para el túnel de acceso a la entrada. Playa de Cascais, en 2011.

Fue condecorado, el 10 de junio de 1084, por el Presidente de la República General Ramalho Eanes con la Orden Militar de Santiago de Espada.

Su obra se puede encontrar en varias colecciones públicas y privadas.

Falleció a la edad de 93 años, el 11 de diciembre de 2013, en Cascais.